Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39AQ5SRH9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms