Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB41Q5JT25 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms