Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR44Q5JSH3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms