Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47AQ5JRC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms