Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF628Q5EBL2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms