Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI3KQ59H18 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms