Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms