Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms