Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms