Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms