Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms