Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF3Q496Y0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms