Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1644Q3SXP7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms