Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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