Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF20Q3BBV1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.2 ms