Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR1Q2NL82 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms