Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms