Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms