Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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