Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD1Q16676 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD1Q16676 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
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