Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGCBQ16585 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms