Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACKR1Q16570 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR1Q16570 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms