Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LY6EQ16553 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms