Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
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