Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RPE65Q16518 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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RPE65Q16518 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPE65Q16518 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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