Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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SSX1Q16384 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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SSX1Q16384 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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