Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USF2Q15853 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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