Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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