Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP1Q15431 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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