Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B3Q15393 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B3Q15393 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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