Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK3Q15120 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms