Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RRS1Q15050 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RRS1Q15050 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RRS1Q15050 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRS1Q15050 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms