Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ODF1Q14990 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF1Q14990 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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