Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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RBM39Q14498 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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