Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB33AQ14088 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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