Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDX39BQ13838 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDX39BQ13838 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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