Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP1A4Q13733 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms