Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PEX6Q13608 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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PEX6Q13608 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PEX6Q13608 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX6Q13608 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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