Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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