Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IKZF1Q13422 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms