Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKP2Q13309 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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