Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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