Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF3Q13114 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAF3Q13114 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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