Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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