Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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PTPRJQ12913 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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PTPRJQ12913 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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PTPRJQ12913 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRJQ12913 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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