Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TP53BP1Q12888 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TP53BP1Q12888 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TP53BP1Q12888 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TP53BP1Q12888 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TP53BP1Q12888 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TP53BP1Q12888 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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TP53BP1Q12888 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP53BP1Q12888 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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