Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2AQ12879 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
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