Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPTFQ12830 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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