Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HMGXB3Q12766 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
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