Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 CDC27YBL084C 2277 nt5.09□□□□□ -1.59
MSB4Q12317 PRP43YGL120C 2304 nt5.09□□□□□ -1.59
MSB4Q12317 SRB4YER022W 2064 nt5.09□□□□□ -1.59
MSB4Q12317 TPO2YGR138C 1845 nt5.09□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 OPT2YPR194C 2634 nt5.09□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 IPT1YDR072C 1584 nt5.08□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 MUK1YPL070W 1839 nt5.08□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 TIF4631YGR162W 2859 nt5.08□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YNR065CYNR065C 3351 nt5.08□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 ADP1YCR011C 3150 nt5.08□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 SSH1YBR283C 1473 nt5.07□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 GPR1YDL035C 2886 nt5.07□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 GIS2YNL255C 462 nt5.07□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 RPS7AYOR096W 573 nt5.07□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YOR102WYOR102W 351 nt5.07□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YAE1YJR067C 426 nt5.06□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt5.06□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 HHF1YBR009C 312 nt5.06□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YPR014CYPR014C 330 nt5.06□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 GRC3YLL035W 1899 nt5.06□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 SEG2YKL105C 3399 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YBL028CYBL028C 321 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 SMY1YKL079W 1971 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YBR238CYBR238C 2196 nt5.05□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 VPS54YDR027C 2670 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 TFB1YDR311W 1929 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 SSS1YDR086C 243 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 GCD6YDR211W 2139 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 GEP4YHR100C 558 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 IRC3YDR332W 2070 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 BBC1YJL020C 3474 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YIL166CYIL166C 1629 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 NUP2YLR335W 2163 nt5.04□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YOL057WYOL057W 2136 nt5.03□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 RBK1YCR036W 1002 nt5.03□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt5.03□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 ECM12YHR021W-A 456 nt5.03□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YNL211CYNL211C 261 nt5.03□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 YPR053CYPR053C 456 nt5.03□□□□□ -1.6
MSB4Q12317 HFA1YMR207C 6372 nt5.02□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 PUF6YDR496C 1971 nt5.02□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 snR7-SsnR7-S 179 nt5.02□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.02□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.02□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 MSS11YMR164C 2277 nt5.02□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 MET4YNL103W 2019 nt5.01□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 YER121WYER121W 345 nt5.01□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 RPS18BYML026C 441 nt5.01□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 YML116W-AYML116W-A 303 nt5.01□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 KEL2YGR238C 2649 nt5.01□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 HOT1YMR172W 2160 nt5.01□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 PFK1YGR240C 2964 nt5.01□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 BCH2YKR027W 2298 nt5□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 MIT1YEL007W 2001 nt5□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 MSH4YFL003C 2637 nt5□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 RAD16YBR114W 2373 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 GYP7YDL234C 2241 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 KIC1YHR102W 3243 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 UPC2YDR213W 2742 nt4.99□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 GAC1YOR178C 2382 nt4.98□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 ERP6YGL002W 651 nt4.98□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 ATP7YKL016C 525 nt4.98□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 LRG1YDL240W 3054 nt4.98□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 ECM22YLR228C 2445 nt4.97□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 REB1YBR049C 2433 nt4.97□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 YGL239CYGL239C 315 nt4.97□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 YIR044CYIR044C 186 nt4.97□□□□□ -1.61
MSB4Q12317 AVT1YJR001W 1809 nt4.96□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 PAA1YDR071C 576 nt4.96□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 YDR286CYDR286C 345 nt4.96□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 USA1YML029W 2517 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 YDL041WYDL041W 354 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 NCE101YJL205C 162 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 ISU1YPL135W 498 nt4.95□□□□□ -1.62
MSB4Q12317 BRE4YDL231C 3378 nt4.95□□□□□ -1.62
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